Аннотация: Предложенный в статье алгоритм на основе выявленных особенностей проявления риска в современной инновационной сфере позволяет проводить анализ, учет и проектирование программы управления рисками в рамках стратегического управления инвестиционными проектами в субъекте экономики, в том числе при реализации инновационных программ (проектов). Результаты могут использоваться для анализа эффективности инновационных программ (проектов) с учетом риска. Применение такого подхода позволяет дать экономическую оценку стратегическому управлению инвестициями в инновационную программу с учетом системы управления рисками, более эффективно использовать результаты, полученные на этапе первичной процедуры анализа риска программы и т.д.